本網(wǎng)訊 記者柏斌 黎蕓熙報道 近日,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝林學(xué)學(xué)院教授傅小鵬研究團(tuán)隊,聯(lián)合中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所武志強(qiáng)研究團(tuán)隊,在國際期刊發(fā)表論文。該論文公開了首次組裝了康乃馨染色體級別的基因組,并解析康乃馨花色、花型和花香等重要性狀調(diào)控密碼。
康乃馨是石竹科石竹屬多年生植物。因其花色絢麗,花型獨特,香氣馥郁,具有極高的觀賞價值和經(jīng)濟(jì)價值,被稱作世界‘四大切花’之一。
據(jù)傅小鵬教授介紹,在華中農(nóng)業(yè)大學(xué)包滿珠教授和bendahmane教授全程指導(dǎo)和幫助下完成的該研究,利用最新的測序技術(shù)(第三代ont、二代illumina和hic技術(shù)),對康乃馨栽培品種‘斯嘉麗’進(jìn)行了全基因組測序,并首次組裝了康乃馨染色體級別的基因組,同時結(jié)合比較基因組,轉(zhuǎn)錄組,代謝組等方法,對康乃馨基因組的進(jìn)化進(jìn)行了系統(tǒng)研究,解析康乃馨的花色、花型和花香等重要觀賞性狀的調(diào)控密碼,鑒定了參與這些性狀形成的關(guān)鍵基因。此外,研究還發(fā)現(xiàn)康乃馨與藜科在64.07 mya發(fā)生了分化,并經(jīng)歷了一次近期的wgt事件,這次加倍事件促進(jìn)了康乃馨特殊香氣丁香酚合成相關(guān)的基因的擴(kuò)張。“該研究成果,為定向改良康乃馨的觀賞性狀,培育康乃馨新品種奠定了基礎(chǔ)?!备敌※i教授說。
據(jù)介紹,研究團(tuán)隊基于本基因組,對康乃馨紅邊花瓣進(jìn)行代謝組分析,發(fā)現(xiàn)天竺葵素的積累促使花瓣紅邊的成色,葉黃素和多個類黃酮物質(zhì)的共同積累,促使花瓣基部成黃色;結(jié)合轉(zhuǎn)錄組分析,篩選到幾個mybs, bhlhs和wrky44等基因共同作用于ans調(diào)控康乃馨復(fù)色的形成。同時,利用gc—ms以及轉(zhuǎn)錄組,對香石竹丁香酚在不同時期花瓣的積累過程進(jìn)行解析,發(fā)現(xiàn)egs基因存在外顯子上的結(jié)構(gòu)變異,其提前終止可能是康乃馨丁香酚丟失的原因。另外,研究發(fā)現(xiàn)康乃馨匯總a、c類基因的異位表達(dá)可能是影響重瓣型康乃馨形成的重要因素。
據(jù)悉,該研究為開展康乃馨重要觀賞性狀的調(diào)控和遺傳改良提供了寶貴的數(shù)據(jù)信息和堅實的理論基礎(chǔ),對推動康乃馨分子育種育種具有里程碑式的意義?!把芯繄F(tuán)隊下一步將會加快分子標(biāo)記開發(fā)、加快康乃馨分子育種步伐;為康乃馨定向育種奠定了基礎(chǔ)?!备敌※i教授表示:
圖為:康乃馨栽培品種‘斯嘉麗’
圖為:康乃馨基因組的組裝與進(jìn)化
圖為:康乃馨重瓣花形成的遺傳機(jī)制